В соответствии с приказом ФТС России от 26.09.2012 № 1922 в целях совершенствования структуры таможенных органов, расположенных в Дальневосточном федеральном округе, с 26 декабря 2012 года Благовещенская и Якутская таможни будут реорганизованы в форме присоединения Якутской таможни к Благовещенской.
 Регион деятельности Якутской таможни будет включен в регион деятельности Благовещенской таможни. Два таможенных поста Якутской таможни (Нерюнгринский и Якутский) с указанной даты без изменения местонахождения переподчиняются Благовещенской таможне, а штатная численность Якутской таможни сокращается.
 С 26 декабря 2012 года аннулируются коды Якутской таможни и коды Нерюнгринского и Якутского таможенных постов Якутской таможни. Таможенным постам Благовещенской таможни присваиваются следующие коды: Нерюнгринскому таможенному посту – код 10704060, Якутскому таможенному посту – код 10704070.