В соответствии с приказом ФТС России от 27 марта 2020 года № 326 с первого октября 2020 года произойдет реорганизация Тверской и Смоленской таможен в форме присоединения Тверской таможни к Смоленской таможне. Таможенные посты Тверской таможни - Западнодвинский, Вышневолоцкий, Кимрский, Ржевский, Тверской таможенный пост, Тверской таможенный пост (центр электронного декларирования) с октября будут переподчинены Смоленской таможне без изменения своего местонахождения и региона деятельности. Таким образом, административные функции, связанные с таможенным декларированием товаров и транспортных средств в Тверской области, перейдут Смоленской таможне.
С 11 июня 2020 года приказом Федеральной таможенной службы № 1452-К от 8.06.2020 года начальником Татарстанской таможни назначен Марат Масгутович Гараев.
С 1 июля 2020 года вводится обязательная маркировка обуви, лекарственных препаратов и табачной продукции. С этой даты не допускается ввоз и оборот на территории России указанной продукции без маркировки. Маркировка призвана защитить потребителя от подделок, повысить собираемость налоговых и таможенных платежей.
В соответствии с приказом ФТС России от 26 декабря 2019 года № 1971, Тывинская и Хакасская таможня будут реорганизованы в форме присоединения к Красноярской таможне. В результате реорганизации в состав Красноярской таможни войдут Кызылский таможенный пост, двусторонние автомобильные пункты пропуска Хандагайты, Цаган-Толгой, Шара-Сур Тывинской таможни, а также Абаканский и Саяногорский таможенные посты Хакасской таможни.
С 1 июля 2020 года Томская таможня будет реорганизована путём присоединения к Кемеровской таможне. Соответствующий приказ был подписан 26 декабря 2019 года руководителем ФТС России Владимиром Булавиным. Решение принято в целях совершенствования структуры и повышения эффективности таможенных органов, расположенных в Сибирском федеральном округе.
С 1 сентября 2020 года таможенные посты Карельской таможни исключаются из Перечня таможенных органов, обладающих компетенцией по совершению таможенных операций, связанных с таможенным декларированием и выпуском товаров в соответствии с заявленной таможенной процедурой. Карельская таможня становится таможней фактического контроля.
С 16 июня 2020 года Улан-Удэнский таможенный пост - центр электронного декларирования (ЦЭД) Бурятской таможни прекращает свою деятельность. Участники внешнеэкономической деятельности могут подать декларации на товары во Владивостокский таможенный пост (ЦЭД) Владивостокской таможни.
Особенности таможенного декларирования товаров, перемещаемых через таможенную границу ЕАЭС в несобранном или разобранном виде, в том числе в некомплектном или незавершенном виде, определяются статьей 117 Таможенного кодекса ЕАЭС. При наличии решения о классификации товара, выданного ФТС России, любой из включенных в решение компонентов товара, ввозимых на территорию ЕАЭС (или вывозимых с нее) в течение установленного срока, может декларироваться путем подачи нескольких деклараций на товары с заявлением кода в соответствии с Товарной номенклатурой внешнеэкономической деятельности, соответствующего коду товара в комплектном или завершенном виде.
С 26 мая 2020 года приказом Федеральной таможенной службы на должность первого заместителя начальника Бурятской таможни назначен капитан таможенной службы Иван Юрьевич Бурлака.
ФТС России налаживает взаимодействие с информационной системой «Одно окно», формируемой на базе цифровой платформы АО «Российский экспортный центр». В частности, для поддержки экспорта, усиления аналитических и субсидиарных компетенций Центра будет организован обмен сведениями таможенной статистики глубокой детализации, необходимой в том числе для создания «Реестра экспортеров» в соответствии с национальным проектом «Международная кооперация и экспорт». Эти данные необходимы и для работы «суперсервисов» информационной системы, создаваемых сейчас рабочей группой под руководством заместителя Председателя Правительства РФ Алексея Оверчука.