Ямало-Ненецкой таможней совместно с Уральским таможенным управлением в 2011 – 2013 годах проводились проверочные мероприятия в отношении ОАО «Авиационная транспортная компания «Ямал» (г.Салехард) по вопросу соблюдения таможенного законодательства при ввозе воздушного судна Боинг 737-500 на таможенную территорию Таможенного союза. В ходе проведенных мероприятий было установлено нарушение таможенного законодательства, которое повлекло неуплату таможенных платежей на сумму 22,9 млн. руб.

Для принятия соответствующих мер, предусмотренных таможенным законодательством Таможенного союза и законодательством Российской Федерации о таможенном деле, материалы проверок направлены в Домодедовскую таможню, в которой произведен выпуск воздушного судна.

Однако, участником внешнеэкономической деятельности - ОАО «АТК «Ямал» решения, принятые таможенными органами, были обжалованы в судах, который принял решение в пользу компании. Но в настоящий момент таможенными органами получены дополнительные сведения от иностранных контрагентов (США), которые позволили подтвердить факт нарушения таможенного законодательства и направить полученные материалы в суд для пересмотра судебных решений по вновь открывшимся обстоятельствам.