В рамках реализации второго этапа формирования единой таможенной территории Таможенного союза с 1 июля 2011 года в соответствии с Решением Межгосударственного Совета ЕврАзЭС (Высшего органа Таможенного союза) от 27.11.2009 г. № 14 и решениями Комиссии Таможенного союза от 21.10.2009 г. № 106, от 25.09.2009 г. № 94 и от 15.03.2011 г. № 76 на внутренних границах стран Таможенного союза предусмотрена отмена таможенного контроля в отношении товаров третьих стран, выпущенных в свободное обращение на территории Российской Федерации, Республики Казахстан и Республики Беларусь. 
С переносом контрольных функций на внешние границы Таможенного союза в пунктах принятия уведомлений на российско-белорусском и в пунктах пропуска на российско-казахстанском участках государственной границы российские таможенные органы прекратят совершение таможенных операций и всех функций по таможенному контролю в отношении товаров и транспортных средств третьих стран, следующих на территорию Российской Федерации.
Мероприятия по переносу таможенного и иных видов государственного контроля определены Планом по переносу согласованных видов государственного контроля на внешнюю границу Таможенного союза. В настоящее время основные мероприятия данного Плана выполнены.
В связи с отменой с 1 июля 2011 г. таможенного контроля товаров и транспортных средств на российско-казахстанской границе в регионе деятельности Сибирского таможенного управления (СТУ) проведены мероприятия по оптимизации структуры и штатной численности Алтайской, Омской, Новосибирской таможен, в том числе с 1 июля 2011 г. ликвидируются 6 таможенных постов: Рубцовский, Михайловский и ДАПП Павловка Алтайской таможни, Нововаршавский, Исилькульский и ДАПП Невольное Омской таможни, сокращена штатная численность должностных лиц, осуществляющих таможенный контроль в пунктах пропуска.