В целях совершенствования структуры таможенных органов, расположенных в Сибирском федеральном округе, приказом Федеральной таможенной службы от 29.06.2011 №1380 принято решение с 30 сентября 2011 года реорганизовать  Забайкальскую и Читинскую таможни в форме присоединения Забайкальской таможни к Читинской таможне.
     В результате объединения в подчинении Читинской таможни будет находиться 12 таможенных постов: Читинский, Агинский, Петровск-Забайкальский, ДАПП Верхний Ульхун, Приаргунский, ДАПП Олочи, Соловьевский, Борзинский, ДАПП Староцурухайтуйский,  МАПП  Забайкальск, ЖДПП Забайкальск, Забайкальский таможенный пост.
     Новый таможенный пост  -  Забайкальский таможенный пост будет создан в процессе объединения двух таможен. 
     Высвобождаемая в результате реорганизации штатная численность аппарата  Забайкальской таможни перераспределится на  таможенные посты.
     В настоящее время обязанности начальника Читинской таможни исполняет полковник таможенной службы Беседин Сергей Иванович.
     Реорганизация двух таможен не отразится на внешнеэкономической деятельности. Все таможенные посты остаются на прежних местах и будут работать в штатном режиме.
     Забайкальский край – не единственный регион в Сибирском федеральном округе, где проходит реорганизация таможенных органов. За последние два года были объединены Бурятская и Наушкинская таможни, Новосибирская и Толмачёвская, Иркутская и Братская таможни.