В структуру ГТК РБ входят:
Управление организации таможенного контроля
Управление организации борьбы с контрабандой и административными таможенными правонарушениями
Управление развития таможенной инфраструктуры
Управление информационных технологий, таможенной статистики и анализа
Управление кадров и подготовки личного состава таможенных органов
Финансово-экономическое управление
Управление тарифного регулирования и таможенных платежей
Договорно-правовое управление
Управление собственной безопасности
Таможенная инспекция
Контрольно-ревизионный отдел
Организационно-инспекторское управление

БРЕСТСКАЯ ТАМОЖНЯ
224013, Республика Беларусь, г. Брест, ул. Гаврилова, 45
Код города по АМТС: 8-0162
Дежурная служба: 47-01-83
Факс: 47-56-71

ВИТЕБСКАЯ ТАМОЖНЯ
210602, Республика Беларусь, г. Витебск, ул.Лазо, 114
Код города по АМТС: 8-0212
Дежурная служба: 35-02-30
Телефон доверия: 35-03-50
Факс: 35-03-60

ГОМЕЛЬСКАЯ ТАМОЖНЯ
246050, Республика Беларусь, г. Гомель, Интернациональная ул., 30
Код города по АМТС: 8 - 0232
Дежурная служба: 79-21-09
Факс:79-21-08

ГРОДНЕНСКАЯ РЕГИОНАЛЬНАЯ ТАМОЖНЯ
230003, Республика Беларусь, г. Гродно, ул. Карского, 53
Код города по АМТС: 8-0152
Дежурная служба: 79-80-06
Факс:2-108-170

МИНСКАЯ РЕГИОНАЛЬНАЯ ТАМОЖНЯ
220007, Республика Беларусь, г. Минск, Могилевская ул., 43
Код города по АМТС: 8-017
Дежурная служба: 218-9666
Факс: 218-9790,218-9679

МИНСКАЯ ЦЕНТРАЛЬНАЯ ТАМОЖНЯ
220046, Республика Беларусь, г. Минск, Холмогорская ул., 57
Код города по АМТС: 8-017
Дежурная служба: 210-5297 т/ф

ТАМОЖНЯ "МИНСК-2"
220054, Республика Беларусь, г. Минск, Национальный аэропорт Минск
Код города по АМТС: 8-017
Дежурная служба: 279-1037
Факс:279-1639

МОГИЛЕВСКАЯ ТАМОЖНЯ
212030, Республика Беларусь, г. Могилев, Первомайская ул., 77
Код города по АМТС: 8-0212
Дежурная служба: 29-90-09
Факс:29-91-02

ОШМЯНСКАЯ ТАМОЖНЯ
231100, Республика Беларусь, Гродненская обл., г. Ошмяны, ул. Я. Коласа, 7
Код города по АМТС: 8 - 015-93
Дежурная служба: 401-65
Факс: 490-08